协议分居到哪里备案

协议分居本身并不需要在特定机构进行备案程序。如果双方决定通过协议离婚，应当签订书面离婚协议，并亲自到婚姻登记机关申请离婚登记。备案地点通常为当地的婚姻登记机构。

具体步骤如下：

准备离婚协议：

双方需就子女抚养、财产分割、债务处理等事项达成一致意见，并形成书面协议。

前往婚姻登记机关：

携带户口簿、身份证、结婚证、离婚协议书等必要文件，共同前往一方当事人长期定居地的婚姻登记机关进行离婚登记申请。

如果双方无法达成协议，可以选择通过法院提起离婚诉讼。在这种情况下，法院将进行审理并记录，无需再进行备案。

综上所述，协议分居不需要进行备案，只需按照相关法律规定，签订离婚协议并到婚姻登记机关办理离婚登记手续即可。